Informace

Najděte koncentraci volných receptorů v roztoku 90% volného ligandu a 10% komplexu receptor-ligand, přičemž znáte pouze hodnotu kD


Mohl bych použít nějaké pokyny, jak použít rovnici pro disociační konstantu kD k nalezení koncentrace volných receptorů [R] v roztoku obsahujícím 90% volného ligandu [L] a 10% vázaného [RL] komplexu.

Kd interakce receptor-ligand = 10^-8 mol l-1

Kde Kd = ([R] [L])/([RL])

Předpokládám, že jako procento mohu uvést [L] = 0,9 a [RL] = 0,1, ale nejsem si jistý, zda volím správný přístup.

Jakékoli vysvětlení k této záležitosti by bylo vítáno.


Jedna velká věc, která vám chybí, jsou jednotky: Koncentrace zde musí mít jednotky koncentrace - nemohou to být bezrozměrná čísla ani procenta.

Jedna z věcí, které musíte zjistit, je, jak převést procenta na jednotky koncentrace. V tomto případě je těžké to udělat přímo, ale můžeme na to přijít trochu algebry. Mluvíme o 90% a 10% ligandu v různých formách, ale nevíme nic o celkovém množství ligandu - to je v pořádku, budeme pouze reprezentovat celkovou koncentraci ligandu jako $ ce { x mol cdot l^{-1}} $. Nyní tedy můžeme konstatovat, že:

$$ ce {[L] = (0,9x) mol cdot l^{-1}} $$ $$ ce {[RL] = (0,1x) mol cdot l^{-1}} $$

Další informací, kterou máme, je rovnice pro Kd:

$$ ce {K_d = frac {[R] [L]} {[RL]}} $$

Hledáme tedy $ ce {[R]} $ (s přidruženými jednotkami koncentrace!) A víme $ ce {K_d} $, $ ce {[L]} $ a $ ce {[RL ]} $ - nebo alespoň do neznáma $ ce {x} $. Pokud ale dosadíte do rovnice hodnoty, které znáte (včetně faktoru $ ce {x} $) a provedete nějakou algebraickou manipulaci, věřím, že zjistíte, že na hodnotě $ ve skutečnosti nezáleží ce {x} $ is - mělo by být zrušeno.

Poznámka: Pokud na hodnotě $ ce {x} $ nezáleží, proč jsem se trápil s celou rigmarolkou jejího zahrnutí? Proč jsem nenahradil přímo 0,9 a 0,1?

Odpověď je moje úvodní věta - koncentrace v rovnici by měly mít (kompatibilní) jednotky koncentrace. Pokud nemáte koncentrace, používáte rovnice nesprávně. (Podívejte se do konceptu dimenzionální analýzy, abyste našli cenný způsob, který vám pomůže zajistit, že mnoho (ale ne všechny) výpočty provádíte správně.)

Zatímco u tohoto konkrétního problému věci fungovaly dobře, pokud přímo nahradíte zlomky/procenta, není to a Všeobecné řešení. V závislosti na přesném nastavení problému $ ce {x} $ s může, ale nemusí být zrušeno čistě. Možná budete muset použít další rovnici/znalosti, abyste na hodnotu $ ce {x} $ vložili další omezení. Jediný způsob, jak to zjistit, je řádně je od začátku účtovat.


Podle informací, které jste poskytli, není počáteční rovnice:

1 x 10EE-8 = (0,9 x [R]) / 0,1

Takže můžete vyřešit pro [R]?

[R] = (1 x 10EE-8 x 0,1) / 0,9

Neříkám, že je to správné, ale nahrazením vámi zadaných hodnot není to, jak by se algebraicky řešilo neznámé? Možná mi něco chybí (?)

Prohlašujete, že chcete znát koncentraci volného receptoru. Nepotřebovali byste znát celkový počet molů receptoru přítomných v rovnovážné vazebné reakci a nepotřebovali byste znát konečný objem reakce?